PCR-電泳法（Gap-PCR法）主要原理是將PCR產(chǎn)物進(jìn)行電泳；而DNA分子在泳動(dòng)時(shí)的電荷效應(yīng)和分子篩效應(yīng)。在一定的電場強(qiáng)度下，DNA分子的遷移速度取決于分子篩效應(yīng)，即分子本身的大小和構(gòu)型。因此不同的DNA分子即被分離出來，與Marker比較可判斷結(jié)果。PCR-反向點(diǎn)雜交法是利用生物素標(biāo)記的探針和特異性擴(kuò)增PCR產(chǎn)物雜交，經(jīng)相應(yīng)的顯色反應(yīng)就能顯出雜交信號，從而判定結(jié)果。